一、个人资料

姓名：马轩

邮箱：skyxma@tjnu.edu.cn；办公地点：明理楼A314

招生专业：生物学/遗传学

二、个人简介

马轩，男，1978年生，硕士生导师。2009年毕业于英国Leeds大学, 植物分子生物学博士。自2010年先后在中科院生物物理所和中科院遗传与发育生物学研究所进行博士后研究工作。2018年到天津师范大学工作，目前讲授本科生《生物化学》和研究生《生物信息学》课程。详细信息参见http://www.biosequencing.cn/。

三、研究方向

研究方向名称：植物表观遗传学

研究内容和研究特色：目前以拟南芥和水稻为材料，研究植物小RNA如何调控基因表达，运用高通量测序技术结合生物信息学研究小RNA在植物生长发育中的重要作用。前期工作对拟南芥小RNA-seq、mRNA-seq和Ribo-seq的分析揭示出内质网的多聚核糖体是phasiRNA的重要合成场所；开发了miRNA靶基因预测工具TarHunter，TarHunter网站（http://tarhunter.genetics.ac.cn）汇集了30种植物miRNA靶基因预测和降解组测序分析的结果。

四、科研成果

代表性论文：

Ma X, Liu C, Gu L, Mo B, Cao X, Chen X. TarHunter, a tool for predicting conserved microRNA targets and target mimics in plants. Bioinformatics. 2018 May 1;34(9):1574-1576.

Ma Xuan, Cao Xiaofeng. Cotton variant genomes-a breakthrough in population genetics analysis. Sci China Life Sci. 2018 Jun 19.

Li Shengben #, Le Brandon #, Ma Xuan #, Li Shaofang #, You Chenjiang, Yu Yu, Zhang Bailong, Liu Lin, Gao Lei, Shi Ting, Zhao Yonghui, Mo Beixin, Cao Xiaofeng and Chen Xuemei (2016). Biogenesis of phased siRNAs on membrane-bound polysomes in Arabidopsis. eLife. 5:e.22750. (# 共同第一作者)

Cui Xia, Lu Falong, Qiu Qi, Zhou Bing, Gu Lianfeng, Zhang Shuaibin, Kang Yanyuan, Cui Xiekui, Ma Xuan, Yao Qingqing, Ma Jinbiao, Zhang Xiaoyu and Cao Xiaofeng (2016). REF6 recognizes a specific DNA sequence to demethylate H3K27me3 and regulate organ boundary formation in Arabidopsis. Nature Genetics 48, 694-699.

Ma Xuan, Mo BeiXin and Cao Xiaofeng (2015). New players in ABA signaling: identification of PUB12/13 involved in degradation of ABA co-receptor ABI1. Sci China Life Sci 58, 1173-1174.

Ma Xuan, Zhu Yingjie, Li Chunfang, Xue Peng, Zhao Yanmei, Chen Shilin, Yang Fuquan and Miao Long (2014). Characterisation of Caenorhabditis elegans sperm transcriptome and proteome. BMC Genomics 15.

Ma Xuan, Cao Xiaofeng, Mo Beixin and Chen Xuemei (2013). Trip to ER: MicroRNA-mediated translational repression in plants. RNA Biology 10, 1586-1592.

Ma Xuan, Zhao Yanmei, Sun Wei, Shimabukuro Katsuya and Miao Long (2012). Transformation: how do nematode sperm become activated and crawl? Protein & Cell 3, 755-761.

Zhao Yanmei, Sun Wei, Zhang Pan, Chi Hao, Zhang Mei-Jun, Song Chun-Qing, Ma Xuan, Shang Yunlong, Wang Bin, Hu Youqiao, Hao Zhiqi, Huehmer Andreas F., Meng Fanxia, L'Hernault Steven W., He Si-Min, Dong Meng-Qiu and Miao, Long (2012). Nematode sperm maturation triggered by protease involves sperm-secreted serine protease inhibitor (Serpin). Proc Natl Acad Sci USA 109, 1542-1547.

Ma Xuan, Zhu Yingjie, Li Chunfang, Shang Yunlong, Meng Fanjing, Chen Shilin and Miao Long (2011). Comparative transcriptome sequencing of germline and somatic tissues of the Ascaris suum gonad. BMC Genomics 12.

主持的科研项目：

1. 主持国家自然科学基金面上项目 “水稻中tRNA衍生的小RNA及其靶基因的系统鉴定和功能研究”（31871321），25万元，在研。

2. 主持博士后科学基金 “拟南芥和水稻中microRNA靶基因的鉴定”（2014M550101），8万元，已结题。

3. 主持留学回国人员科研启动基金“线虫精子细胞活化的分子机理研究”，4 万元，已结题。

五、学术兼职和社会兼职

天津市植物生理与分子生物学学会理事